概要
第1期 伝説の7つの宝石 カオスエメラルド を巡り、悪の天才科学者 Dr.エッグマン と激闘を繰り広げていた ソニック たち。その戦いの最中、カオスエメラルドが揃ったことによって発生した大規模な時空の歪み（ カオスコントロール ）に巻き込まれ、ソニックたちは彼らの住む世界によく似た別の世界（人間の世界：地球がモチーフ）に飛ばされてしまった。 ソニックは一緒に飛ばされてきた仲間たちやその世界で出会ったクリスたちの力を借りて「世界征服できるならどこでもいい」と世界征服を始めたDr.エッグマンに立ち向かっていく。 第2期 宇宙から現れた謎の機械生命体 メタレックス 。その襲撃により、7つのカオスエメラルドは宇宙に飛散し、ソニックたちの星は生命の源である プラネットエッグ を奪われてしまった。時を同じくして宇宙から飛来した少女・ コスモ からメタレックスの野望を知らされたソニックは、いつもの仲間たち、コスモ、そして自ら開発した転送装置を使ってソニックたちの世界へやってきた18歳のクリスと共に、宇宙船「 ブルータイフーン号 」に乗って、メタレックスの野望を阻止すべく宇宙へと旅立つ。